Не перестану повторять, UNIX и Windows должны использоваться тогда, когда в этом есть смысл и необходимость. Если у вас на предприятии есть локальная сеть, если пользователи пользуются какими-то общими ресурсами, если вы хотите разделять полномочия пользователей в зависимости от их должности, вам нужна операционная система Windows Server с настроенной Active Directory. Если вы хотите иметь собственный почтовый сервер, если вам нужен собственный DNS-сервер, лучшим решением будет запуск сервера с операционной системой FreeBSD (или Linux).

В Интернете существует масса описанных способов создания подобия домена и Active Directory (с использованием Samba). Но это не совсем не то. Достойную альтернативу AD подобным образом не создать. Вы можете изучить массу литературы по настройке и администрированию Windows Server, но стабильно работающий веб-сервер, почтовый сервер вам не удастся создать на нём. В качестве DNS-сервера в UNIX-системах используют BIND. Служба сервиса доменных имен (DNS), работающая в среде Windows, является ничем иным как портированным [?] портированием называют адаптацию программного обеспечения к работе в среде, отличающейся от той, для которой изначально программа была создана для Windows приложением BIND. Поэтому тут можно добиться стабильной работы.

Не стоит делать выбор в пользу UNIX-систем только из-за того, что они бесплатные. Очень грамотным решением является выбор в пользу какого-либо пакетного серверного программного обеспечния. Не жадничайте, покупайте программное обеспечение, когда это уместно. Это прекрасно.